המים המשמשים בבתים, עסקים ותעשיות מטופלים לרוב בתהליך כימי להסרת חומרים מזיקים וחיידקים. לאחר הטיפול במים כימיים, ניתן למחזר אותם בבטחה למקור המים. ניתן להשתמש בכמה כימיקלים שונים לטיפול במים, כמו כלור, סיד וחמצן מי חמצן. כל שיטה מציעה יתרונות וחסרונות ברורים לשימוש בטיפול במים.
כלור
על פי המועצה לאיכות ובריאות המים, לפני השימוש במי שתייה כלוריים בראשית המאה, מחלות הנישאות במים כמו כולרה, קדחת טיפוס הבטן, דיזנטריה והפטיטיס טענו כי אלפי חיילים בארה"ב כל שנה. כיום, הכלור הוא עדיין שיטת החיטוי הנפוצה ביותר למי שתייה ציבוריים ובריכות שחייה. לא רק שהכלור עוזר במניעת התפשטות זיהומים כמו E. coli, הוא גם משמיד חיידקים, אצות ועובש שיכולים לצמוח על קירות מערכות אחסון מים, והוא מסיר טעמים וריחות לא נעימים ממי השתייה. בעוד שכלור יעיל בחיטוי מי השתייה, זה יכול להיות קשה להתמודד ללא מומחיות וניסיון. כלור המים המשמשים להתקלחות, הלבנת כביסה ושחייה עלולים לייבש את העור והשיער, עלול לגרום לגירוי בעיניים ויכול גם לדעוך בדים.
ליים
מים קשים מכילים רמות גבוהות של מינרלים מומסים, שיכולים להצטבר בצינורות מים ובמערכות פנימיות כדי לגרום לחסימות ולנזקים קבועים. מרככי מים המיוצרים עם סיד מתוק יכולים לטפל באיכות מים כדי לשפר מים קשים וגם להפחית את רמות הארסן הרעיל במי השתייה. הסיד גם משנה את רמת החומציות של המים ופועל להשמדת הסביבה הנדרשת לגידול חיידקים ווירוסים. במקרים מסוימים, רמות החומציות הופכות גבוהות מדי עם התרככות סיד. כאשר מוסיפים סיד למים עם כלור, ההיווצרות של היפוכלוריט היא חומר חיטוי הנחות משאר כלור חופשי.
מי חמצן
מי חמצן הוא חומר הלבנה אשר ניתן להשתמש בו להלבנת שיניים, להבהרת שיער ובדי הלבנה וטקסטיל. ניתן להשתמש בו גם לחיטוי מים על ידי הסרת מזהמים ועיכוב גידול של חומרים חיידקיים. מי חמצן נחשבים בדרך כלל לבטוחים, הם אינם מייצרים שאריות או גז, וניתן להשתמש בהם בכדי להסיר שאריות כלור שנותרו מאחור מהכלור. יש להעביר את החומר ולטפל בזהירות, שכן מגע עם מי חמצן עלול לגרום לגירוי בעיניים, בעור, בריאות ובקרומים הריריים. בנוסף, Lenntech מציינת כי מחקרים שנערכו על ידי הסוכנות הבינלאומית האמריקאית למחקר סרטן מצביעים על חשיפה גבוהה לרמת מי חמצן יכולה להיות מסרטנת לבעלי חיים.
