לזיהום בכל צורה שהיא יש השפעות שליליות על הסביבה ועל הצמחים השוכנים בה. לזיהום יש מקורות רבים, החל מהזרמה ישירה של נפט פסולת לנתיבי מים ועד זיהום אוויר מפליטת רכב. חלק מההשפעות הן לטווח קצר ומתקלות בקלות. השפעות אחרות הן לטווח הארוך, כאשר מזהמים נמשכים בסביבה או מצטברים ברקמות הצמח. פוטוסינתזה היא תהליך חיוני בתוך המערכת האקולוגית. באמצעות אור שמש, פחמן דו חמצני ומים, צמחים מייצרים מזון ואנרגיה בתהליך כימי המתרחש בעלים של צמחים.
זיהום יכול להפחית את יכולתו של הצמח לעבור פוטוסינתזה.אוזון ועלים
חילופי גזים דרך נקבוביות או עגבניות עלים מספקים את הפחמן הדו-חמצני הדרוש לפוטוסינתזה. עם זאת, מחקר שפורסם בשנת 1980 במדעי החיים התאית והמולקולרית מצא כי זיהום אוויר מקטין את גודל הסטומטות, מה שמפריע לחילופי הגזים. די בפחמן דו חמצני לא יכול להאט או להפסיק פוטוסינתזה. זה נתמך עוד יותר על ידי מחקר שנערך בשנת 2004 מצא כי זיהום אוויר מפחית את יבול היבול.
זיהום מקור שאינו נקודתי
זיהום מקור שאינו נקודתי הוא זיהום שמקורו במקורות רבים ומגוונים ונכנס לסביבה באמצעות נגר מי שטח פנים. נגר חקלאי הוא המקור העיקרי לזיהום מסוג זה, על פי הסוכנות האמריקנית להגנת הסביבה (EPA). נגר מכניס חומרי הדברה ודשנים לנתיבי מים. לפעמים, ההשפעה היא מיידית והצמחים מתים במהירות. רמות גבוהות של זרחן מדשנים עלולות לגרום לפריחת אצות. פריחות אלגליות מגדירות תרחיש בו הפוטוסינתזה מאטה ונפסקת לבסוף ככל שרמות החמצן המומס יורדות במים ומים עכורים מגבירים את זרימת אור השמש לסביבות מימיות.
זיהום אדמה
זיהום קרקע משפיע על פוטוסינתזה ברמת השורש. גשם חומצי הנגרם כתוצאה מפליטת דלקים מאובנים מגביר את חומציות הקרקעות הגורמת להתרחשות כימיקל ויוצר יוני אלומיניום רעילים. יונים אלה פוגעים ביכולתו של הצמח לקחת חומרים מזינים ובכך מאטים את תהליך הפוטוסינתזה ואת הצמיחה הכללית של הצמח.
אפקט החממה
אוזון בגובה הקרקע שנוצר כתוצאה מאפקט החממה יכול ליצור תנאים לא קלים להתרחשות הפוטוסינתזה. ריכוזי גזי חממה כמו פחמן דו חמצני מונעים את שחרור החום הקורן מהסביבה. טמפרטורות השטח עולות, מה שמגביר את קצב האידוי. מים הופכים לגורם מגביל. כדי לשמור על משאבים יקרים, צמחים יסגרו את העגבניות שלהם, ויפחיתו את הזמינות של פחמן דו חמצני לצמח. עם מוגבלת של פחמן דו חמצני ומים, הפוטוסינתזה מאטה.
נזק פיזי
זיהום יכול להפריע ליכולתו של הצמח לעבור פוטוסינתזה על ידי פגיעה פיזית בעלים במקום בו הם מתרחשים. אוזון גורם למצב שנקרא כלורוזיס, בו עלי הצמחים הופכים לצהובים מרמות כלורופיל לא מספיקות. כלורופיל חיוני להתפתחות פוטוסינתזה. אם הרמות יורדות, כך גם פוטוסינתזה. בריכוזים גבוהים זיהום עלול להרוס מבני צמחים שיגרמו לצמחים להפסיק את ייצור המזון על מנת להתמודד עם מתחים סביבתיים.
