סוגי השורשים מתחלקים לשתי קטגוריות עיקריות: רקמות ושורשים סיביים. מערכת טפט מורכבת משורש ראשי יחיד גדול שצומח מתחתית הזרע ומגיע עמוק לתוך האדמה לרטיבות. שורשים סיבים הם רשתות מורכבות של שורשים קטנים יותר החודרים את האדמה לכל הכיוונים הרחק מהצמח בחיפוש אחר מים וחומרים מזינים ובאופן כללי קרובים לפני השטח של האדמה. עצי תפוחים משתמשים בשני סוגי השורשים.
תפוחים מוכנים לקטיף על עץ המראים תפוקה טובה.פונקצית שורש
שחיקה חושפת שורשי עץ רדודים לאורך זמן.השורש הוא החלק הראשון של העץ היוצא מהזרע, שכן הוא משמש לעגן את הצמח לאדמה והוא צינור התזונה העיקרי שלו. מערכות שורשים של עצים מתחרות בצמחים בקרבת מקום, ויוצרות לרוב רשת שורשים מורכבת ממש מתחת לפני השטח של האדמה. גשמים עזים ושחיקה חושפים לרוב את השורשים הרדודים יותר שנראים לעין במרחק טוב מהעץ שייצר אותם.
טפטים
גזר הם דוגמאות לטפטים אכילים.דוגמה טובה לצמח המורכב מטרטוט בודד היא גזר. זהו מקרה בו השורש הבודד ממשיך להתארך, ומייצר אוכל אכיל. במקרים בהם איכות האדמה ירודה, הגזר מייצר בעיקר צמרות ירוקות ושיש אך מעט מאוד שורש. טרטוט מוארך מקשה על השתלת עצים וצמחים, מכיוון שהוא דורש חפירת חור שאורכו לפחות, אם לא ארוך יותר, מהשורש בכדי להיקבר לחלוטין.
שורשים סיביים
צמחים רבים, כולל עצי תפוח, מתחילים על ידי שליחת תפוחים שממנה צומחים שורשים לרוחב או סיבי. הטרפט מפסיק לצמוח, והשורשים הרוחביים מסתעפים לכל הכיוונים הרחקים ממנו. בחלק מהמקרים מערכות השורש מגיעות להיקף שהוא יותר מפי שניים מכתר העץ.
עצי תפוח
כמה עצי תפוח גמדיים מתחילים לייצר תוך שנתיים מיום נטיעתם.עצי תפוח מתפתחים מתוך טפרוט המפתח בסופו של דבר שורשים לרוחב. עצי תפוח מגדלים במשתלה לרוב חותכים את הטרטוטים שלהם כדי לעודד את צמיחתם של שורשים לרוחב. זה הופך את האריזה למערכות השורש הקומפקטיות ליעילות יותר וגם הופכת את ההשתלה למוצלחת יותר.
גמד שורש
עצי תפוח קטנים יותר וקטנים יותר מיוצרים על ידי גמדת מערכות השורש שלהם, מה שמגביל את גודלו של העצים. החסרונות לתהליך זה כוללים יצירת מערכות שורש חלשות שיאפשרו לעצים הקטנים יותר להישען תחת המון פרי כבד. עצי תפוח גמדיים או גמדים למחצה זקוקים גם להשקות תכופות יותר, מכיוון שמערכות השורש הסיביות המפוזרות שלהם אינן מסוגלות להיאחז במים כמו עצים מלאים.
